Kjellerinstituttet Norsk institutt for luftforskning (NILU) har sine arbeidsområder innen miljøforskning med vekt på kilder til luftforurensning, atmosfærisk transport, omvandling og avsetning. Foreløpig er UNIKs samarbeid med NILU begrenset til at forskere ved UNIK gir faglig veiledning til studenter ved NILU. Med utbygging av fagområdet Energi og miljøforskning ved UNIK, åpner det seg muligheter for økt samarbeid om undervisning og forskning.